一般分为细菌、真菌、放线菌、螺旋体、支原体（霉形体）、衣原体、立克次氏体、病毒这么几大类，现在人们又把朊病毒(锯蛋白)也加进来了，它被怀疑是疯牛病的病原。大致便是这样，没有发现更新的分类法。
其间原核细胞型又依据其生物学特性的不同分为不同的类别：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次氏体。
当然在这种分类上有些是有不同见地的，比方放线菌，由于其有菌丝、孢子、并以孢子割裂方法进行繁衍，曾经把它归为真菌类。
而现在以为它只要一个拟核，应和细菌类似，所以以为它是一种界于细菌和真菌之间的微生物，在分类上仍归于原核细胞型。跟着人们对微生物的研讨和知道程度的逐步深化，在纷歧起期人们对微生物的分类也纷歧致，现在人们倾向于微生物分类的三域学说。
跟着人们对微生物知道的逐步深化，从两界体系经历过三界体系、四界体系、五界体系乃至六界体系，直到70年代后期，美国人Woese等发现了地球上的第三生命方法－古菌，才导致了生命三域学说的诞生。该学说以为生命是由古菌域（Archaea）、细菌域（Bacteria）和真核生物域（Eucarya）所构成。
古菌域包含嗜泉古菌界（Crenarchaeota）、广域古菌界（Euryarchaeota）和初生古菌界（Korarchaeota）；细菌域包含细菌、放线菌、蓝细菌和各种除古菌以外的其它原核生物；真核生物域包含真菌、原生生物、动物和植物。
1。非细胞型微生物：最小。无典型的细胞结构，无发生能量的酶体系，只在活细胞内成长繁衍。核酸类型为DNA活或RNA,两者纷歧起存在。病毒归于这一类。
2。原核细胞型微生物：这类微生物的原始核为环状裸DNA团状结构，无核膜，核仁，细胞器很不完善，只要核糖体。
DNA和RNA一起存在。这类微生物品种繁复，有细菌，支原体，衣原体，立克次氏体，螺旋体和放线菌。由于后五类结构和组成与细菌类似。将其列入广义细菌范畴。
不同于以上三类微生物的一个特别：前一时期的疯牛病的病原体是朊粒（prion)又称感染性蛋白粒子，是医学生物学范畴中至今未完全澄清的一种蛋白质感染因子。
一般分为细菌、真菌、放线菌、螺旋体、支原体（霉形体）、衣原体、立克次氏体、病毒这么几大类，现在人们又把朊病毒(锯蛋白)也加进来了，它被怀疑是疯牛病的病原。大致便是这样，没有发现更新的分类法。
其间原核细胞型又依据其生物学特性的不同分为不同的类别：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次氏体。
当然在这种分类上有些是有不同见地的，比方放线菌，由于其有菌丝、孢子、并以孢子割裂方法进行繁衍，曾经把它归为真菌类。而现在以为它只要一个拟核，应和细菌类似，所以以为它是一种界于细菌和真菌之间的微生物，在分类上仍归于原核细胞型。跟着人们对微生物的研讨和知道程度的逐步深化，在纷歧起期人们对微生物的分类也纷歧致，现在人们倾向于微生物分类的三域学说。
人类在发现和研讨微生物之前，把全部生物分红天壤之别的两大界－动物界和植物界。跟着人们对微生物知道的逐步深化，从两界体系经历过三界体系、四界体系、五界体系乃至六界体系，直到70年代后期，美国人Woese等发现了地球上的第三生命方法－古菌，才导致了生命三域学说的诞生。该学说以为生命是由古菌域（Archaea）、细菌域（Bacteria）和真核生物域（Eucarya）所构成。
古菌域包含嗜泉古菌界（Crenarchaeota）、广域古菌界（Euryarchaeota）和初生古菌界（Korarchaeota）；细菌域包含细菌、放线菌、蓝细菌和各种除古菌以外的其它原核生物；真核生物域包含真菌、原生生物、动物和植物。
1。非细胞型微生物：最小。无典型的细胞结构，无发生能量的酶体系，只在活细胞内成长繁衍。核酸类型为DNA活或RNA,两者纷歧起存在。病毒归于这一类。
2。原核细胞型微生物：这类微生物的原始核为环状裸DNA团状结构，无核膜，核仁，细胞器很不完善，只要核糖体。DNA和RNA一起存在。这类微生物品种繁复，有细菌，支原体，衣原体，立克次氏体，螺旋体和放线菌。由于后五类结构和组成与细菌类似。将其列入广义细菌范畴。
不同于以上三类微生物的一个特别：前一时期的疯牛病的病原体是朊粒（prion)又称感染性蛋白粒子，是医学生物学范畴中至今未完全澄清的一种蛋白质感染因子。其最主要成分是一种蛋白酶抗性蛋白（PrP),至今未发现核酸，对各种理化要素抵抗力强。具有感染性，潜伏期长。在人和动物中引起海绵状脑病（TSE）为特征的致死性中枢神经体系的缓慢退化性疾患。1997年Prusiner由于发现PrP和TSE高度相关，并且对PrP进行了生化，分子生物学，免疫组化和转基因动物试验而取得诺贝尔奖。关于prion的研讨已逐步成为微生物研讨中的热门。
微生物是指那些个别体积直径一般小于1mm的生物集体，它们结构简略，大多是单细胞，还有些乃至连细胞结构也没有。人们一般会凭借显微镜或许电子显微镜才干看清它们的形状和结构。需求阐明的是微生物是一个比较抽象的概念，界限有时会非常含糊。如单细胞藻类和一些原生动物也应算是微生物，但一般它们并不放在微生物中进行研讨。
按我国学者提出的分类法将生物分红六界：病毒界、原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界。不难看出微生物在六界中占了四界，因而微生物在自然界中的重要位置是清楚明了的，其研讨的目标也是非常广泛而丰厚的。
微生物(Microorganism)是广泛存在于自然界中的一群肉眼看不见，有必要凭借光学显微镜或电子显微镜扩大数百倍、数千倍乃至数万倍才干观察到的细小生物的总称。它们具有体形细小、结构简略、繁衍敏捷、简单变异及适应环境能力强等长处。
一、真核细胞型微生物 细胞核的分解程度较高，有核膜、核仁和染色体；胞质内有完好的细胞器（如内质网、核糖体及线粒体等）。真菌归于此类型微生物。
二、原核细胞型微生物 细胞核分解程度低，仅有原始核质，没有核膜与核仁；细胞器不很完善。这类微生物品种很多，有细菌、螺旋体、支原体、立克次体、衣原体和放线菌。
三、非细胞型微生物 没有典型的细胞结构，亦无发生能量的酶体系，只能在活细胞内成长繁衍。病毒归于此类型微生物。
微生物在自然界中的散布极为广泛，空气、土壤、江河、湖泊、海洋等都有数量不等、品种纷歧的微生物存在。在人类、动物和植物的体表及其与外界相通的腔道中也有多种微生物存在。
绝大多数微生物对人类和动、植物的生计是有利而必需的。自然界中氮、碳、硫等多种元素循环靠微生物的代谢活动来进行。例如空气中的很多氮气只要依托微生物的效果才干被植物吸收，土壤中的微生物能将动、植物蛋白质转化为无机含氮化合物，以供植物成长的需求，而植物又为人类和动物所使用。因而，没有微生物，植物就不能推陈出新，而人类和动物也将无法生计。
在农业方面，人类广泛使用一些微生物的特性，拓荒了以菌造肥、以菌催长、以菌防病、以菌看病等农业增产新途径。在工业方面，微生物在食物、制革、纺织、石油、化工等范畴的使用越来越广泛。尤其是在医药工业方面，简直一切的抗生素都是微生物的代谢产品，别的还可使用微生物来制作一些维生素、辅酶等药物。
即使是许多寄生在人类和动物腔道中的微生物，在正常状况下也是无害的，并且有的还具有拮抗外来菌的侵袭和久居，以及供给人类必需的营养物质（如多种维生素和氨基酸等）的效果。
有一小部分微生物能引起人类或动、植物的病害，这些具有致病性的微生物称为病原微生物。有些微生物在正常状况下不致病，而在特定条件下可引起疾病，称为条件性病原微生物。
按体系发育和细胞结构它们分归于细菌，古菌和线.不具有细胞结构的病毒，类病毒行寄生日子，它们的许多日子特性类同于寄主生物。
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